章太炎滿懷希望前往上海，結果是黯然回到了杭州。不過，他這趟上海之行還是有收獲的，他結識了一些真朋友，所以他在回到杭州不久，在接受譚獻、孫詒讓的勸說放棄繼續寫作《新學偽經考駁議》後，就和幾位浙江籍的朋友發起成立了“興浙會”。
興浙會有時又被稱作興浙學會，成立時間大約為1897年6月，參與創辦的有董祖壽、連文激、章太炎、宋恕、陳虯等。章太炎在《興浙會序》中指出，浙江為中國東南地區最具優良傳統的省份，在浙江曆史上曾出現過五位值得浙人自豪的民族英雄，即參與推翻蒙元民族統治“論功最高”的劉基，抗擊蒙古貴族入侵而令“北虜震燥”的於謙，“學與政兼之”的大學者王陽明，“比跡其子，以闡大同”、“聖智摩慮”之黃宗羲和堅貞不屈、“功敗身殲”而“後世尤悲其誌”的抗清名將張煌言。這五位民族英雄為浙人樹立了好榜樣，他們之所以成立興浙會，也就是要繼承浙人的優良傳統，振興浙江，進而振興中國、振興亞洲。
從興浙會宣言看，這一團體顯然具有政治目的，而這一政治目的並不僅僅是為了改革政治，好像潛伏著一種對體製對滿清的不滿。這種看法是否就是反清訴求，似乎還可商量，但這個學會絕不是一個單純的學術團體似乎是真的。因為從它所表彰的五位民族英雄事跡看，至少興浙會的參與者已漸漸對滿洲人和它的政府失去了信賴和信心。
根據興浙會章程約定，該會以研討劉、於、王、黃、張五公的學問為職誌，但也不排斥與會者博覽群書，更不鼓勵與會者墨守成規，獨守五公之學，而是鼓勵學者各從性情所近，研討中國曆史文化尤其是曆代典章製度，大抵以《周禮》、兩戴記為最要，由訓詁通大義，足以致用。史以三史、《隋書》、《新唐書》為最要。子以管、墨為最要，另外再加上荀子。至於經世之學，興浙會章程主張“法後王”，以為雖當代掌故，稍遠者亦芻狗。格致諸藝，專門名家；聲光電化，為用無限。而學者或苦於研精罩思，用心過躁，卒無所成。大抵精敏者宜學格致，驅邁者宜學政法。官製、兵學、公法、商務，三年有成，無待悴掌。且急則治標，斯為當務。若自揣資性與藝學相遠，當亟以政法學為趨向。將向西方學習視為當時中國最急迫的任務。
在研討內容上，興浙會格外強調輿地學的重要性，認為應該借鑒西方近代以來的地理學方法重新繪製中國地圖，尤其是對浙江的地理環境更應該有新的認識，方輿之學，中外共之。近如《地理全誌》等書，臚列頗詳，而陋塞險要所在，卒不可知。坤輿方圖之屬，徒著其形，未明其說，則閱者亦摘填索塗爾。至中國輿圖，殊鮮善本，強調興浙會應該致力於浙江地理方輿之學的研究。
興浙會之外，章太炎還和朋友一起創辦了一份《實學報》旬刊，擔任該刊總撰述。在章太炎撰寫的《實學報敘》中，嚴厲批評那些不忍攻苦、又不敢自認淺陋的所謂“高才之士”，以為他們往往道聽途說，撼拾一二皮毛，就牽強附會，到處炫耀，其實隻是皮毛，隻是浮光掠影，中國最需要的不是這種浮誇而是踏實的知識。這是章太炎在《實學報》時期的基本信念。
《實學報》之外，章太炎還參與創辦譯書公會和《譯書公會報》，這也是章太炎在那時迅速成名的一個途徑。
譯書公會的創辦宗旨是為了翻譯介紹近代東西方新知識，使中國人得窺近代東西方各國走向富強的緣由和途徑，所以這份雜誌不僅關注東西各國政治、學校、法律等事務，而且更重視天文、輿地、礦務、農學、軍事等科學技術知識的介紹。章太炎《譯書公會序》中期望譯書公會和《譯書公會報》能使中國人接受新知識的進度大幅提升，積少成多，積沙成塔，為中國富強與進步貢獻心智。