很多人對段永平的理解往往停留在“巴菲特門徒”的層麵上，在他們看來，段永平就是巴菲特的翻版或者是小號的巴菲特，他的一切都在跟隨巴菲特。這種認知非常片麵，主要體現在兩點上：首先，段永平投資過很多巴菲特不看好的企業，而且獲得了不錯的收益；其次，巴菲特的門徒有很多，國內也不少，但段永平絕對是最好的巴氏投資理念傳承者之一。
如果進行一番分析，就會發現，段永平對於巴菲特的很多理念和投資很認同，但他並不覺得其中一些投資適合自己，他也從來沒有打算跟著巴菲特的腳步進行投資。在投資方麵，他認同並且善於運用巴菲特的理念，但這並不意味著他事事跟隨巴菲特，尤其在具體的投資選擇上，段永平有自己的主見。
比如在2020年，由於蘋果公司的股價下跌，巴菲特出售了部分蘋果公司的股票，此舉引發了伯克希爾·哈撒韋公司的震動。段永平對此也表示不理解，他在蘋果的投資上，比巴菲特要更加堅決，持股的時間要更長久。
又比如巴菲特不喜歡投資互聯網公司。他認為互聯網公司的泡沫很大，盈利模式根本看不懂，風險很大。相比之下，段永平對互聯網公司沒有那麽排斥，他認為互聯網本身並不屬於泡沫：“這個東西我們天天在用，怎麽會是泡沫呢？”他很早就主動接觸新浪、網易、搜狐和聯眾等互聯網公司，了解相關的情況，他還和互聯網公司的CEO一起吃過飯，甚至購買了一些股票。他非常看好一些盈利不錯的互聯網公司，無論是網易、拚多多，還是騰訊，段永平都展示出極大的投資熱情。他對阿裏巴巴也非常看好，隻不過是因為阿裏的一些業務他看不懂，才沒有投資。
另外，段永平對巴菲特的一些投資也表示看不懂，他從來不強迫自己在具體的投資上跟隨巴菲特。有一次，巴菲特投了一家公司，而且資金投入量很大。很多人問段永平為什麽不跟進。段永平覺得這隻股票不適合自己。很快，巴菲特投資的股票漲了50%，別人問段永平著不著急，他平淡地說自己為什麽要著急。在他看來，自己不懂這家公司，也看不懂它的價值，所以沒有必要冒險投資，更不會因此而後悔。
反觀一些投資者，經常關注巴菲特準備買什麽股票，會跟著巴菲特進行投資，但很少有人會堅持到底。在近幾年的伯克希爾·哈撒韋公司股東大會上，很多人都會談到中國市場的投資機會，會詢問什麽項目適合投資，巴菲特常以“我不知道”“無可奉告”之類的話“帶”過，有人覺得巴菲特故意不肯透露信息，其實這種觀點非常片麵，一方麵巴菲特代表了伯克希爾·哈撒韋公司全體股東的利益，他沒有任何理由告訴外人“什麽項目適合投資”；另一方麵，即便巴菲特告知別人應該投資什麽，其他人也未必可以駕馭。
很多投資者缺乏獨立的投資思維，可能90%以上的人不具備獨立投資能力，跟風投資變成了他們最常用的手段。之所以跟風，就是因為多數人不具備投資的能力，專業知識匱乏，沒有投資的經驗，甚至沒有一個穩定的投資模式（今天學這個，明天學那個）。他們對於自己的投資本身就缺乏信心，隻能寄希望於大多數人的選擇，但時間證明跟風投資者容易成為接盤者，這一點在股市中最為明顯。
除了跟隨投資大師的腳步之外，還有一種常見的現象就是聽從所謂的專家、權威人士和一些投資谘詢人士的建議，很多人尤其喜歡根據投資助理的想法行事，並認為這是一種穩妥的辦法，畢竟自己支付了不菲的報酬。但是很多提供投資幫助的人不會真正給出實質性的建議。早在2008年，巴菲特在致股東的信中就特別談到了投資助理的問題，他認為很多人相信並樂於傾聽“投資助理”的建議，實際上是將自己推向一種糟糕的境地。“很自然地，每個人都期望收益超過市場的平均水平。那些‘投資助理’由衷地鼓勵和灌輸他們的客戶這種觀念。但是作為一類雇用這些投資助理的群體，他們的收益一定是低於平均水平的。原因很簡單：①所有的投資者不可避免賺到一個平均的投資回報，減去交易費用；②被動型投資者和指數投資者，由於他們從頭至尾的交易不是很活躍，能賺到的收益是平均收益，減去一個非常低的交易費用；③在賺取市場平均收益的群體中，剩下的一部分就是交易活躍的投資者。但是這個群體也會因此招致高額的交易、管理和顧問谘詢費用，所以交易活躍的投資者，相比他們那些不活躍的‘同胞’會抹去很大一部分的投資回報。這意味著：‘懵懂無知’的被動型投資者（與他們相比）一定會勝出。”
段永平從來不重視所謂的投資建議，朋友們也會推薦一些好的投資項目，段永平會認真進行分析，如果不符合自己的投資標準，就絕對不會投資。在最初做投資的時候，他對美國的投資氛圍著迷，但是電視上的一些股市專家和投資助理，給股民們提供的炒股方法和標的，段永平從來不相信，也不收看這類電視節目。
還有很多投資者將華爾街投資者當成風向標，隻要華爾街投資者有動靜，立馬格外關注，華爾街投資者看好某隻股票，就在這隻股票上加大投入，但段永平從巴菲特那兒學到的知識是，華爾街的投資者一直都在誤導投資者，如果有好的投資項目，他們是不願意分享給投資者的。他曾經這樣分享自己的理念：“如果我做一個上市公司，我也不理他們，我該幹嗎幹嗎，股價高低跟我沒有關係的。所以我買公司的時候，我有一個很大的鑒別因素就是，這家公司的行為跟華爾街投資者對他的影響有多大的關聯度？關聯度越大，我買他的機會越低。華爾街投資者沒有錯，華爾街投資者永遠是對的，它永遠代表不同人的想法。但是你要自己知道在幹什麽，如果你自己沒有主見，你要聽華爾街投資者的，那你就亂了。”
當然，要想保持獨立的投資意識，還需要擁有分辨是不是謠言的能力。大多數投資者遭遇過各種各樣的謠言，一些企業、投資者、投資機構為了自身的利益，甚至會製造謠言，通過謠言來誤導投資者做出錯誤的判斷。段永平很少關注這些謠言，常會選擇從正規渠道了解上市公司所發布的信息，對那些所謂“內部消息”更是保持警惕。他更願意相信自己的分析和判斷，比如對相關的企業或者股票進行驗證，了解這家公司基本的運作情況，包括盈利、負債、股東收益報酬率。段永平會花費大量的時間研究企業的基本麵信息，並想辦法驗證信息的可靠性，然後再考慮是否符合自己的投資標準。
段永平自稱是一個獨立的投資人。他不願意開投資公司，很大一部分原因是一旦成立了公司，不僅要對股東負責，還容易在投資中受到股東的影響，投資一些自己不看好或者不感興趣的項目。
在段永平看來，個人獨立投資的優勢在於堅持自我，隻要自己有原則、有標準，就不太容易受到外界的幹擾。早在經營步步高公司時，公司內部就成立了一個幾十人隊伍的投資小分隊，這個投資小分隊會四處收集投資信息。比如，有一段時間，很多互聯網公司開始堅持自己開發各種網絡遊戲，投資小分隊的任務就是，所有成員每天必須花很多時間玩網上的遊戲，包括網易公司的遊戲以及其他互聯網公司的遊戲。通過這種方式，段永平可以更精準地知道中國網民喜歡什麽遊戲，遊戲公司將會推出什麽遊戲，以及遊戲中出現了什麽問題，而這些公司在處理問題時又是如何做的，它們是表現出了急功近利的想法，還是顧及長遠利益。通過遊戲體驗，投資小分隊往往可以更好地了解不同互聯網公司的狀態，並且找出這些公司所麵臨的一些問題。