佛學研究中心
那爛陀寺住持派四名高僧前來迎接，玄奘跟著他們走了大約一百裏，終於來到了那爛陀寺。“那爛陀”本義為“施無厭”。
傳說那爛陀寺的南麵有個芒果林，林中有個水池，池中有條名叫那爛陀的龍，因寺廟建在這個水池旁，就以此為名。釋迦牟尼涅槃以後，連續六代的摩揭陀國王都在此興建寺廟，最後在外圍砌成一道大磚牆，把所有寺廟圍起來，成為大伽藍。伽藍設有一座總門，內部分成八院，各院均擁有自己的庭園。整個建築看來鱗次櫛比、錯落有致，園中景致很美，有樹木，有流水，圍牆外是芒果林，規模宏大，建築美輪美奐，印度數以萬計的伽藍無一可以比擬。
那爛陀寺就相當於一個完整的佛教大學，以大乘佛典為主，兼有小乘佛教的課程，寺中僧侶在一萬人左右。此外佛教經典之外，僧人們還兼修《吠陀》古典經文及因明學、聲明學、醫藥以及數學等課程。
當時摩揭陀國的統治者就是曲女城的戒日王，戒日王大力支持佛教，所以那爛陀寺的經費來源穩定，戒日王曾下令以一百邑，也就是兩萬戶人家為那爛陀的封邑，這兩萬戶人家每天進奉的米、乳酪和牛奶多達幾百石。
生活條件豐裕，僧侶們就可以專心研讀，所以那爛陀從四五世紀以來就是印度的佛學研究中心，培養出了大批大師，例如掀起印度空宗、有宗大辯論的清辯論師與護法論師，以及護法之傳人戒賢大師、智光大師。
寺內的高僧大德都能嚴守戒律，自興建七百多年以來，還不曾發生過違犯寺規之事，這是寺內僧侶最感驕傲的一點。那爛陀的寺規嚴格，第一原則就是絕對不準僧侶們有任何藏私，每個人住的僧房都隻裝一扇很高的門，沒有門簾，相互間可以看得很清楚。一旦有事，就集合全體上萬僧侶一起討論，場麵很是壯觀。據說遇有重大事件，需要僧侶一一表決，隻要一人不讚同，則事不得成。管錢糧的，哪怕是私取半升之粟，就會被毫不留情地逐出寺院。那爛陀寺僧侶不受政府管理，一般人民必須入王籍，僧侶則不列入，犯寺規的人要交由僧眾大會議處。
那爛陀寺在當時很有社會地位，這是一所偉大的佛教大學，是印度當時的佛學研究中心，所以也正是玄奘萬裏跋涉而來的目的地。玄奘隨四位高僧先到了寺外莊園，據說這裏是佛陀十大弟子中，神通第一的目連降生之地，玄奘被安排先在此進餐並略作休息。
剛剛要休息的玄奘突然聽到屋外人聲嘈雜，原來有兩百多名僧侶，率領一千多位善男信女朝這邊走來，有的手捧鮮花香火，有的撐著幢幡，浩浩****地來到莊園歡迎玄奘。玄奘就在一大群人的簇擁下進入了那爛陀寺。
那爛陀寺
寺中主要的僧侶們早就集合在一起等候玄奘的到來，他們將玄奘請到上座。莊嚴的鍾聲響過之後，有僧人宣布說：“從現在開始，玄奘就在本寺住下，本寺一切佛具、器物，可任由使用。”然後又有二十位通曉經律、儀表端莊的青年僧侶陪同玄奘去拜見那爛陀寺的首席大德正法藏。正法藏就是戒賢大師，據說他當時已經一百多歲了，僧侶們因為尊敬他，不敢直呼其名號，所以就以“正法藏”稱之。
玄奘恭敬地走到戒賢前方，以手肘和足膝著地，匍匐而行到戒賢跟前。這是印度最高的敬禮，一番寒暄之後，戒賢讓玄奘和高僧們一同坐下。
“你從哪裏來?”戒賢問他。
“我從遙遠的東土大唐而來，目的是要來向大師學習《瑜伽師地論》，以便在東土弘揚佛法。”戒賢就是研究《瑜伽師地論》的權威，玄奘自認為據實以告，沒什麽出奇之處，他萬萬沒料到，戒賢聽了他的話竟然老淚縱橫。發現玄奘一臉的困惑，戒賢就把他的弟子，也是他的侄兒覺賢叫來，這是個博學且健談的七十多歲的老人，戒賢要他當眾把自己三年前患病的經過向玄奘說明。
“正法藏本來就患風濕症，每次發作起來都痛苦難當，三年前的發病尤為嚴重，痛到使他不想活下去，於是正法藏打算絕食了斷。他有了這個念頭以後，忽然夢見三位天人來找他，一人為金黃色，一人為碧綠色，另一人為銀白色，每個人都風采不凡。他們對正法藏說：‘經典裏雖有苦修的說法，但絕沒有教人自絕生命的地方。要知道今世之果乃前世之因，你現在受這種苦頭，必是源於你上輩子造的孽。為今之計應該好好忍耐，盡力弘揚經論，以抵消你過去的罪孽，這樣才能避免來世遭受同樣的痛苦。’正法藏聽了連忙向他們膜拜。這時金黃色人指著碧綠色人對正法藏說：‘這位就是觀世音菩薩。’接著指著銀白色人說：‘這位就是慈氏菩薩（彌勒）。’，正法藏就向慈氏菩薩說：‘我一直希望來世能轉生到菩薩身邊，不知可不可能?’慈氏菩薩回答說：‘隻要你能全力弘揚佛法，來世就可以實現願望。’通過金黃色人的自我介紹，正法藏知道他就是文殊菩薩，文殊菩薩對他說：‘我知道你要自絕，所以特地趕來勸你，隻要你能把《瑜伽師地論》傳揚到還沒看到這部經法的地方去，你身體上的病痛自然就會痊愈。’接著他又說：‘你不必主動派人去宣揚，很快就會有一位支那高僧來這裏向你求教，他會把《瑜伽師地論》帶回去並發揚光大。你一定要等他教他!’然後三位天人就不見了蹤影，正法藏從夢中醒來，不可思議的事情就發生了，從那天以後，他的風濕病就完全好了。”
眾僧聽了覺賢的話都嘖嘖稱奇，玄奘更是悲喜交集，說：“如果真是這樣，弟子必定竭盡心智，努力學習《瑜伽師地論》。”
戒賢若有所思地問：“你來到摩揭陀，從出發到現在一共花了多少時間?”
玄奘屈指一算，從貞觀元年秋天從長安出發，到現在貞觀三年秋，正好滿三年，而戒賢的那場夢，也正是發生在三年前，這些時空的吻合，使他們越相信彼此間之緣分實屬天意。玄奘又想起了沿途的見聞，想到佛教即將在印度淪滅的景象，在菩提樹下引起的內心悲痛，偏偏在這種時候，菩薩托夢要求印度大師等他前來受教，玄奘很自然地聯想到，難道佛陀的意思是要他把印度的佛學遺產整個宣揚到中國去?玄奘突然生出一種莊嚴的使命感，這也許就是使他後來成為承前啟後、成為印度與中國佛學的橋梁的原動力吧。
從戒賢大師那裏離開後，玄奘來到了寺中的幼日王院，住在第四重閣，七天後又被安置在專供多聞大德住宿的上房，位於原供戒賢之師護法菩薩住的房間之北。那爛陀寺每天都撥給他很多用品，包括擔步羅果一百二十個、檳榔二十個、豆蔻二十顆、龍腦香一兩、供大人米1升。這種米是摩揭陀的特產，比黑豆還大，用它做米飯既香且鮮，其他任何一種米都沒法和它相比，由於隻供國王和最有成就的大德食用，所以得名。
玄奘每個月還可以享用油三鬥，酥乳等則按實際需要提供。而且還分給玄奘一名淨人（侍奉僧人的俗人）、一名婆羅門以供差遣。玄奘無須做一切僧侶的雜務，出門可坐象車。玄奘所享受的待遇，在整個那爛陀寺中，隻有十個人可以享受得到。隻身遠遊的玄奘能獲得如此禮遇，是件很難得的事，不過玄奘的成就也確實配得上這些待遇。在整個那爛陀寺，精通經論二十部的有一千人，精通三十部的有五十人，而精通五十部以上的卻隻有十人，玄奘就是其中之一。
玄奘在遊覽各地聖跡的途中被四名高僧接到了那爛陀寺，他意猶未盡，在寺中將一切都安頓好以後就迫不及待四處尋“跡”朝拜。由於不是遠遊，不用為生計發愁，玄奘這一次能夠看得特別仔細，這也是在《大唐西域記》中，僅摩揭陀國就占去八九兩卷篇幅的原因之一。
此地聖跡多達百餘處，其中讓玄奘最感興趣的，就是屬王舍城的部分。王舍城有新舊之分，舊王舍城，因盛產上好香茅，所以叫“上茅宮城”，城的形狀是東西長而南北短，群山環繞，東北是釋迦牟尼曾居住過的鷲峰山，峰山多棲鷲鳥，故名鷲峰，釋迦牟尼曾在此講《法華》等經，佛家視此山為聖地，中國有不少山即以此為名。山上有釋迦牟尼真人大小的雕像。為了要上山聽釋迦牟尼說法，王舍城的頻毗娑羅王特地在此打造了石階。釋迦牟尼在此山度過很長的時間。
玄奘到達時，還有一些磚造的房子，是曾經的竹林精舍的遺跡。東邊有供奉佛祖舍利的佛塔，阿難的一半遺骨也供在此處。
南麵是毗婆羅山，山北有石屋名為“七葉窟”，在這裏曾發生過一件對佛教影響很大的事情。佛陀於娑羅林涅槃時，他的大弟子大迦葉正在同一條路上遊化，在快到拘屍那迦城國的時候，大迦葉從一個婆羅門的口中得知佛陀圓寂的消息，整個教團中的比丘們都很震驚，有痛不欲生的，也有靜坐默念無常的，隻有一位老年才出家的老比丘出人意料地說：“比丘們！莫憂愁，莫悲歎，我們現在可以脫離那個大沙門而獲得自由了，從現在起我們可以隨心所欲了！”
大家隻是沉默，沒有人理會這位老比丘的話，但身為十大弟子之首的大迦葉，卻在這些話中獲得啟示，心中保持警惕，一處理完佛陀的遺骨，他就和同門弟子們商量道：“我們眼前的第一件大事，就是設法用最快速度，把佛陀遺留下來的教法和戒律結集起來。否則恐怕很快就會有非法、非律的人起來壓製遵守佛陀正法、正律的人。我們必須先發製人，在這種狀況尚未發生之前完成結集！”
這個建議很快地獲得比丘們的讚同，大家決定到七葉窟集合，無數的僧眾趕到那裏，大迦葉將各人了解佛法的程度作為標準，最後淘汰了很多人，剩下九百九十九人。
他們結集的方法可稱之為“合誦”，大家選出一位比丘站在眾僧中央，這個比丘必須是熟知某一部分佛陀說過的法或戒律，由他回想佛陀所說的話，然後與會的比丘們進行鑒定。如果大家一致認同，或修改後經過大家的認可，則眾人就繼續研究推敲，把它整合為一定的內容，最後所有人重新合誦一次或多次。這樣一來，與會者就能熟記佛陀說過的法。這是一種記誦時代的編集方式，史稱“第一次結集”，而七葉窟作為第一次結集的場所，自然有著非同尋常的紀念意義。這些被傳誦的經文和律文不久就被以正式的文字記錄下來，成為後世所見的最初的佛典。
那次站在中央擔任口誦的人就是被佛陀讚為“多聞第一”的阿難，他背誦了佛陀的教法，即“經”的部分。戒律的部分，則由“持戒第一”的優婆離負責背誦。這次的結集總共曆時三個月，相當於是佛教的第一次宗教會議。
除了這個以大迦葉為首的宗教會議以外，那些被大迦葉淘汰的僧侶們心有不甘，就在離七葉窟一二十裏處的地方舉行了一個同性質的結集會議，那裏的結集工作也聚集了數千人，他們的成果也得以留傳後世，被稱之為大眾部結集。而以大迦葉為首的僧侶結集的經律，因為以大迦葉居上座，所以稱為上座部結集。
從舊王舍城出來，玄奘一直往東北走，就到了新王舍城，也就是後人所稱的王舍城。在玄奘西行的時代，那裏的外城郭已毀，但是內城還在。關於這個城的興建，還有一些傳說。
相傳頻毗娑羅王在舊王舍城的時候城內十分繁榮，人口眾多，考慮到民房緊密相連，稍一不小心就可能釀成火災，所以國王下令凡是被查明放火的人，就得被放逐到城外的寒林。寒林是個棄置死屍的場所。這個處罰算是相當嚴厲了。
不料有一天王宮失火，國王覺得自己既然是王宮的主人，就應當負起責任，於是就指派太子代理政務，自己跑到寒林裏住帳篷。相鄰的吠舍釐國王聽到消息後認為這是個千載難逢的好機會，想要在此時發動戰爭，於是下令立刻備戰。消息很快傳到摩揭陀國來，國王無奈之下就在寒林附近就地築城，有人說之所以新城叫做“王舍城”，就是因為王住在此處。後來他的兒子幹脆就遷都於此，直到阿育王把這個城贈給婆羅門，自己則遷到波吒厘子城，這個新王舍城中已經住有千戶的婆羅門，城郭已倒塌，幾乎無跡可尋。