中央的平定很快，因為大總統布拉德雷在平民之中的人氣非常高，屬於國民英雄那種，所以這次行動的黑鍋就給了軍方高層。
古拉曼迅速宣布，高層意圖發動政變，要進行危險的實驗，並且將人偶兵等拍成照片發給了報社，宣稱大總統發現之後，因為無法控製中央一些高層，秘密指令東方司令部和北方布裏克斯要塞士兵進入中央，壓製軍方高層。
可惜軍方高層狗急跳牆，發動政變，並且殺死了大總統，古拉曼隻能在悲痛之中接過了國家的領導權，繼承大總統的遺誌，帶領這個國家。
報紙上登出了古拉曼還有大總統夫人的照片。
布拉德雷夫人非常配合古拉曼的演出，扮演著總統遺孀的身份，作為交換，作為她兒子的塞利姆則還給了她。
即使知道了塞利姆是活了幾百年的人造人，她仍然將塞利姆當作親兒子一樣愛，不過塞利姆這麽危險的人造人，是不可能直接還給她的，霍恩海姆也可憐這個母親，這些也算是瓶中小人惹的禍，霍恩海姆願意收尾。
他親自出手，廢掉了塞利姆體內的賢者之石，塞利姆現出了微縮版嬰兒的原形，然後用煉金術重新塑造肉體，這樣，失去了記憶的塞利姆被重新塑造了身體，還給了布拉德雷夫人。
古拉曼自命為大總統後又開始了大量的調令和政治交換，並且將馬斯坦任命為新的東方司令部負責人，將阿姆斯特朗少將任命為北方司令部的負責人，這兩人都成為了中將的頭銜，各自開始去接收軍區，拱衛古拉曼的統治地位。
西方和南方司令部在觀測了局勢之後，也選擇了臣服，古拉曼總算是有驚無險地度過了權利的交接。
在得知霍恩海姆等人的研究之後，古拉曼全力支持，開放中央全部研究機構，包括國家煉金術師機關中的研究資料和軍方以前對賢者之石和人造人的研究，這些如果出成果，都是可以增強亞美斯特利斯戰鬥力的。
有了霍恩海姆的加入，研究的進度大大加快，兩個月的時間就成功了。
成果表明，其他生物的靈魂也是可以的，畢竟之前軍方就做過實驗，將狗的靈魂轉移到人的體內，說起來動物也是有靈魂的。
不過煉製賢者之石的時候發現，靈魂的質量是有很大區別的，基本上就是越高等、智商越高的動物，靈魂之中蘊含的能量越高，煉製成的賢者之石越好，越低等、越沒有思維的生物，煉製賢者之石的質量越低。
之後，利用從屠宰場調過來的大量豬，成功煉製了能用的賢者之石，用量彌補了質，造出了可以使用的賢者之石。
剩下的已經死去的豬就直接送到中央的食堂去了。
看著被送出去的豬，一豐心裏感慨道：
這樣的豬肉是沒有靈魂的！
第二天，利用這個豬-賢者之石，愛德華再次進行了人體煉成，以賢者之石為代價，換回了自己的胳膊和腿。
確保沒有問題之後，大家又補充了賢者之石，阿爾馮斯再次進行人體煉成，將自己的的身體換了回來。
當枯瘦如柴的阿爾馮斯出現之後，愛德華和霍恩海姆都激動地流眼淚了。
一豐也很高興，近幾個月自己學到了很多煉金術，還搞到手了不少賢者之石，動物版和軍方以前研究剩下的人類版的都有。
至於要不要見一眼真理，猶豫了一段時間，一豐決定要試一次。
說是人體煉成，也不是要煉成誰，就是為了見一眼真理。
這個世界的真理，相當於“神”“天道”“根源”這種組成世界的基本的知識和規則，通過禁忌的人體煉成，可以以一定代價獲得知識。
為了未來，一豐需要獲得足夠的知識，甚至是成為魔人的方法，那麽，從真理那裏尋找知識，就是一種很好的辦法。
一豐很猶豫，是因為原著中瓶中小人的一句話：
“為了不讓人類得意忘形，要給你們正確的絕望，這就是真理。”
想要複活孩子的伊茲米，失去了再次懷孕的可能。
想要母親的兄弟倆，失去了能夠感受懷抱的身體。
顧念兄弟的愛德華，失去了提攜兄弟的胳膊。
想要改變國家的馬斯坦，失去了看這個國家未來的眼睛。
真理的等價交換，非常讓一豐顧忌。
如果被真理取走了魔力該怎麽辦？或者是心髒呢？現在的天生牙可沒有在心髒缺失的情況下長久複活的能力。
一豐和霍恩海姆交流了很久，霍恩海姆為了感謝一豐的幫助，也幫一豐策劃了好久，幫助還原了當年瓶中小人毀掉科爾克賽斯王國的煉成陣。
那個煉成陣中，獲得知識和賢者之石的，是瓶中小人和霍恩海姆，兩人卻沒有支付任何代價，所有代價都是賢者之石支付的，這個方法比愛德華、伊茲米等的人體煉成要好很多。